ノーマルビュー

英国・ロンドン、ワクチン由来ポリオウイルスの感染が広がっている可能性

著者: headless
2022年6月25日 11:39
英国健康安全保障庁 (UKHSA) は 22 日、医薬品医療製品規制庁 (MHRA) との共同調査によりノースロンドン及びイーストロンドンの下水サンプルからポリオウイルスを検出したと発表した (プレスリリースBBC News の記事Sky News の記事Ars Technica の記事)。

定期的な調査で年 1 ~ 3 件のワクチン様ポリオウイルスが検出されるのは普通だが、検出は常に一度限りであり、再び検出されることはなかったという。このような現象は海外で経口生ポリオワクチン (OPV) を摂取した個人が帰国または訪英し、一時的にワクチン様ポリオウイルスの痕跡が便に含まれることが原因だ。今回の調査では遺伝的に密接な関連を持つ複数のウイルスが 2 月~ 5 月に下水サンプルから検出されたため、調査が続けられている。

ウイルスは現在、ワクチン接種が完全でない人に麻痺などの深刻な症状を引き起こす可能性もあるワクチン由来ポリオウイルス2型 (VDPV2) に分類されている。VDPV2 の検出はノースロンドンとイーストロンドンで個人間の感染が広がっていることを示唆する。現時点で関連付けられた麻痺の症例は報告されていないが、調査は市中感染の有無を確認するのが目的だ。

英国で最後にポリオの自然感染が確認されたのは 1984 年であり、2003 年にポリオ根絶を宣言した。ロンドン市民の大半はポリオの完全な免疫を持っているが、5 歳以下の子供はワクチン接種が完了していないこともあるので、国民保健サービス (NHS) が保護者への連絡を開始するとのことだ。

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小惑星探査機「はやぶさ2」が持ち帰った砂から20種以上のアミノ酸

著者: nagazou
2022年6月10日 08:10
「はやぶさ2」が小惑星「リュウグウ」で採取に成功したサンプルを分析した結果、生命に関係が深いアミノ酸が20種類以上検出されたことが各メディアで報じられている。情報の出本は文部科学省であるようだ。詳細に関しては近く論文で公開される見通しとのこと(朝日新聞テレ朝news日経新聞NHK)。

サンプルは初期分析の段階で、炭素や窒素といった有機物を構成する物質が含まれていることは判明していたという。その上でたんぱく質の材料になるアミノ酸があるかが注目されていた。ヒトの体内のたんぱく質を形作るアミノ酸は20種類あるが、そのうちの体内でつくることのできないイソロイシンやバリン、コラーゲンの材料になるグリシンのほか、グルタミン酸なども確認されたとしている。

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謎の古生物「パレオスポンディルス」はミッシングリンク的存在だった

著者: nagazou
2022年5月31日 06:09
これまで正体不明だった謎の脊椎動物「パレオスポンディルス」の正体について、理化学研究所などが正体を突き止めたと発表した。理化学研究所と東京大学が26日に発表をおこなったもので、パレオスポンディルスは、約4億年前の中期デボン紀の湖に堆積した地層から産出する化石種だそうで、全長5cmほどの小さな動物であるという。様々な特徴があることから、1890年に初めて報告されて以降、脊椎動物のどのグループに属するのか定まっていなかったとのこと(論文理化学研究所リリースTECH+朝日新聞)。

あるAnonymous Coward 曰く、

理化学研究所などの研究チームが約4億年前の古生物化石「パレオスポンディルス」を肺魚と陸上脊椎動物の中間にあたる生き物と推定したという研究結果を発表した。

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生命の起源に迫る発見。アミノ酸は酵素なしにRNAだけでも重合すると判明

著者: nagazou
2022年5月27日 14:29
最初の生命はどうやって遺伝情報を翻訳したが解明されたそうだ。地球に存在する生命体は、遺伝情報を翻訳機(リボソーム)を使ってタンパク質に変換しているそうだ。作られたタンパク質は遺伝子の自己複製にも使われている。しかし、遺伝子を機能させるには上手く機能するリボソームが必要で、リボソームを作るには遺伝子にリボソーム)の情報が含まれている必要があるため、ニワトリと卵の関係のようなパラドックスが発生してしまうのだという(NatureLMUリリースナゾロジー)。

ドイツのルートヴィヒ・マクシミリアン大学(LMU)のFelix Müller氏らによる研究により、初期生命の遺伝子とRNAそのものにアミノ酸の重合を独自に行う機能があることがあることが分かったそうだ。11日のNatureにその研究に関する論文が掲載されているとのこと。

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遺伝子操作したブタの心臓を移植後2か月で死亡した男性の症例、ヒトには感染しないブタのウイルスが要因か

著者: headless
2022年5月8日 10:02
米国で遺伝子操作したブタの心臓を移植された男性が 2 か月ほどで死亡した症例について、ヒトには感染しない豚サイトメガロウイルス (PCMV) の感染が要因の一つになったとみられているそうだ (MIT Technology Review の記事The Verge の記事)。

2 年前にドイツの研究グループが実施したブタの心臓をヒヒに移植する実験ではヒヒが最長 195 日間生存しているが、PCMV が存在すると 2 週間ほどで死んでしまったという。研究グループはヒヒの免疫を薬で抑制しただけでなく、ブタの免疫システムも働かないためにウイルスが爆発的に増殖したと考えており、ヒトでも同様の現象が起こる可能性があると警告していた。

男性の場合は手術から 20 日後の採血で PCMV の存在を示す兆候がみられたものの、そのレベルは非常に低く、ブタは病原体フリーであることが保証されていたため、チームでは誤検知だと考えたという。しかし、この検査には 10 日を要するといい、その間にウイルスが急速に増加した可能性もある。

実際 43 日目に男性は感染症らしき症状で発熱。AIDS 患者に使用することもあるシドフォビルを投与したほか、静注用免疫グロブリン製剤を投与していったん症状は落ち着いた。しかし、1 週間後には再び悪化し、心臓は弱っていく。投与した血液製剤には抗-ブタ抗体が含まれていたことがのちのテストで判明しており、医師は 2 回の投与で心臓に負担を与えたことも懸念しているという。

最大の懸念事項であった拒絶反応が起きなかったとはいえ、ウイルス感染を医師が防げない状況で移植を行うべきではなかったとの批判も出ているとのことだ。

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日本の研究グループ、炭素質隕石から遺伝子の主要核酸塩基 5 種すべてを同時検出

著者: headless
2022年5月3日 13:32
北海道大学や JAMSTEC などの研究グループが 3 種の炭素質隕石から、すべての生物の DNA・RNA に含まれる核酸塩基 5 種の同時検出に成功したそうだ (北海道大学のプレスリリースJAMSTEC のプレスリリースScience News の記事Nature の記事)。

5 種の核酸塩基 (ウラシル・シトシン・チミン・アデニン・グアニン) のうち、プリン塩基であるアデニンとグアニンはその他の有機化合物とともに、1960 年代から隕石中で検出されている。一方、ピリミジン塩基は隕石中の前駆的化学物質からも生成されることが予想されながら微量のウラシルが検出されたことがあるのにとどまり、シトシンとチミンは検出されたことがなかった。

今回、研究グループではマーチソン隕石 (オーストラリア・ビクトリア州) とタギッシュレイク隕石 (カナダ・ブリティッシュコロンビア州)、マレー隕石 (米国・ケンタッキー州) に対し、常温の超純水で化合物を抽出するという、北海道大学の大場康弘准教授らが開発した最新の手法を用いて検出を実施。前生物的な遺伝子の候補となる核酸塩基 5 種すべてを含む 18 種類の核酸塩基類の網羅的な検出に世界で初めて成功したという。

冥王代の地球には隕石などの地球外物質が現代よりも多く供給されており、これに伴って地球外から供給された大量の塩基対が地球最初期の生命における遺伝的機能の発現に貢献したと考えられるとのこと。はやぶさ2 や OSIRIS-REx が持ち帰る小惑星サンプルからの検出も期待される。

なお、論文では地球上での汚染の可能性について分析しているが、核酸塩基が地球外のものであるという説得力のあるデータが示されていないとの批判もみられる。

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米国の未成年者、75 % に SARS-CoV-2 感染歴があるとの調査結果

著者: headless
2022年4月30日 15:15
米疾病予防センター (CDC) の最新の調査結果によると、米国の未成年者 (0 — 17 歳) のおよそ 75 % で SARS-CoV-2 (COVID-19 の原因となる新型コロナウイルス) 感染歴が血清学的に確認されたそうだ(CDC の週次報告書 MMWRArs Technica の記事)。

この数字は 2 月時点のもので、採取した血清サンプルの抗ヌクレオカプシド (N) 抗体を検査して陽性率 (血清有病率) を調べている。抗 N 抗体は SARS-CoV-2 感染により作られるが、現在米食品医薬品局 (FDA) が緊急使用許可または認可しているワクチンの接種では作られない。

未成年者の血清有病率およそ 75 % のうち、3 分の 1 は SARS-CoV-2 オミクロン株 (B.1.1.529) が優勢となった昨年 12 月以降の新規感染によるものだ。12 月から 2 月の間に血清有病率の増加幅が最も大きかったのはワクチン接種率の低い 0 — 11 歳で、44.2 % → 75.2 % と増加、12 — 17 歳が 45.6 % → 74.2 % で続く。成人では 18 — 49 歳が 36.5 % → 63.7 %、50 — 64 歳が 28.8 % → 49.8 %、65 歳以上が 19.1 % → 33.2 % のように増加した。成人の方が増加幅は小さいものの、増加率は高く、18 — 49 歳が最も高い。全体では 33.5 % から 57.7 % に増加している。

ただし、これらの結果は 1) 便宜的抽出による一般化可能性の制限や、2) 人種や民族に関するデータの欠如により重み付けできないこと、3) すべてのサンプルが臨床検査で採取されたことによる医療機関をよく利用する人への偏り、4) ワクチン接種後の感染では抗 N 抗体の力価が低下するうえ、抗 N 抗体による血清有病率では再感染を確認できないため累積感染者数が低く見積もられる、といった 4 つの制約があるとのこと。

これらの結果はオミクロン株の高い感染率、特に子供の感染率の高さを示す好例となる。血清の抗 N 抗体が陽性であっても将来の感染を防ぐことにはつながらず、ワクチン接種が SARS-CoV-2 感染による合併症を防ぐ最も良い方法であることに変わりない。ブースター接種によりワクチン接種状態を維持することは、感染歴のある人を含めて接種可能なすべての人に推奨されるとのことだ。

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カナダの研究者、3Dバイオプリンターで精細管のモデルを作成

著者: nagazou
2022年4月25日 17:04
やや時間の経過した話題となるが、カナダのブリティッシュコロンビア大学の泌尿器科助教授であるRyan Flannigan博士らのチームは、3Dバイオプリンターを使用して、睾丸の内部メカニズムを再現しようとする試みを行っているそうだ。現在治療ができない男性の不妊症の患者の治療に使うことを目的にしているという(UBCEuronews)。

チームは、非閉塞性無精子症(NOA)を患っている患者の睾丸から幹細胞を収集、細胞を成長させた。そして精子を生成する精細管に似た中空の管状構造に3Dプリント。精子を生成する能力を持つ有望な初期兆候を確認することに成功したとされる。幹細胞は、人工精管内で生き延びただけでなく、繁殖し、精子を生産する能力の初期兆候を示したとのこと。こうした実験の成功は世界初だという。

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筑波大学ら、蚊の発育を停止させるフラボノイドを発見

著者: nagazou
2022年4月16日 05:29
筑波大学などの研究グループが、蚊の成長を止める化合物を発見したそうだ。発見されたフラボノイドの一種を与えると脱皮や変態に必要な昆虫ホルモンの合成を妨げるとされる。実際、蚊の一種であるネッタイシマカにこのフラボノイドを与えた結果、発育が停止したとされている。既存の殺虫剤よりも他の生物への影響が少なく、なおかつ環境負荷の少ない殺虫剤製造につながる可能性があるとしている(日経新聞)。

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超簡単に短時間で人工細胞を作製する手法

著者: nagazou
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headless 曰く、

JAMSTEC の研究グループが超簡単に短時間で人工細胞を作製する手法を確立したそうだ (プレスリリース論文)。

人工細胞は脂質で形成した人工細胞膜に様々な分子を閉じ込めて生化学的な反応を行う。しかし、脂質膜形成に現在よく利用されている界面通過法などの方法は数時間から一昼夜の時間を要するほか、論文にあまり記載されない軽微だが重要なコツが多くあり、レシピだけで質の高い人工細胞を再現性良く作ることは困難だったという。

人工細胞の作製にはリン脂質が均質に溶けた脂質オイル溶液を準備することが重要だ。今回の手法ではガラス管の中で簡易的に脂質フィルムを作り、オイルを加えた後 70 ℃ で 1 分間温めてすぐに撹拌するという手順に界面通過法を単純化し、今までと同等以上の人工細胞を 30 分以内で再現性良く形成できるようになったとのこと。

また、必要な試薬を乾燥させることで、水と目的の遺伝子、卓上遠心機やボルテックスなどの簡単な機器さえあれば、どこでも人工細胞を作ることが可能になった。人工細胞研究は生命創造の可能性を秘めた研究分野として大きく注目されているが、今回の研究成果は誰でも簡単に人工細胞実験ができるキット化を可能にするものであり、サンプル中に特定のウイルスや生物の DNA が存在するかどうかを判別するバイオセンサーとしての応用なども期待できるとのことだ。

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魚にも右利きと左利きがある

著者: nagazou
2022年4月13日 06:04
世界淡水魚園水族館「アクア・トトぎふ」と名古屋大、富山大の共同研究チームによると、特定の種類の魚には体の左右一方をよく使う「利き」があるそうだ(読売新聞)。

しかし「利き」がいつ獲得されるかは不明な点が多いとのこと。富山大の竹内勇一助教らは、獲物を左右どちらから襲うかという「利き」の違いが分かりやすいペリソダス・ミクロレピスという魚に着目。ただこの魚、気性が荒く育成が困難だったことから「アクア・トトぎふ」に繁殖を依頼し繁殖に成功。魚の生育過程を調査し、4か月の幼魚と8か月の若魚、12か月の成魚に初めて獲物を襲わせて捕食成功率を調べたところ、遺伝的な影響が高いことが分かったとしている。

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抗体薬ソトロビマブも新型コロナウイルスの変異に敗北

著者: nagazou
2022年4月8日 14:27
あるAnonymous Coward 曰く、

ソトロビマブの投与を受けた豪州のデルタ株感染患者を追跡調査した結果、ソトロビマブ
に耐性を持つ変異を検出したとのこと(日経メディカル)。

ソトロビマブは、武漢株及びアルファ株からオミクロン株までの全変異株に対して効果が期待できる抗体薬であり、さらに新型コロナウイルスを含む既知のサルベコウイルス亜属の全てに対して中和作用を示すとされていたが、新型コロナウイルスの変異能力の方が上手だった模様。もう何処かでソトロビマブに耐性を持つオミクロン亜株が発生してるかも知れない。

オミクロン株に対して効果が期待できる抗体薬としては、他にアストラゼネカ社のチキサゲビマブ・シルガビマブがあるが、まだ日本では未承認で、しかもワクチン接種との併用は推奨されていない(国立研究開発法人日本医療研究開発機構日経メディカル)。

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SARS-CoV-2 オミクロン株、感染しても他の変異株に対する免疫はほとんど獲得できないという研究成果

著者: headless
2022年3月27日 19:43
サンプル数は 59 人と少ないが、新型コロナウイルス (SARS-CoV-2) オミクロン株 (BA.1)感染では他の変異株に対する免疫がほとんど獲得できず、ワクチン接種が必要になるというオーストリアの研究グループの研究成果が発表された (The New England Journal of Medicineの記事Ars Technica の記事)。

研究ではオミクロン株感染前の免疫状態により、SARS-CoV-2 に感染したことがなくワクチン接種済み (15 人)・未接種 (18 人) と D614G 変異株・アルファ株・デルタ株のいずれかに感染したことがあるワクチン接種済み (11 人)・未接種 (15 人) の 4 グループに分け、最初に PCR 検査でオミクロン株陽性となってから 5 日 ~ 42 日後の血清サンプルを調査している。

その結果、ワクチン接種済みの人は過去の感染の有無にかかわらず、D614G・アルファ株・ベータ株・ガンマ株・デルタ株に対する抗体価がオミクロン株に対する抗体価よりも高く、すべての変異株に対する免疫が認められたのに対し、未接種・未感染の人はオミクロン株以外の変異株に対する抗体価が低く、一部の人で一部の変異株に対する免疫が認められるのみだったという。過去に感染したことがある人の傾向はワクチン接種済みと似ているが、うち 3 人はオミクロン株以外に対する免疫が認められず、PCR 検査が誤検知だった可能性もある。

今回の研究はサンプル数の少なさなどもあり限定的な調査にとどまるが、オミクロン株がこれまでの変異株との交差反応性の低い免疫回避変異株であるという仮説を支持する結果であるとのことだ。

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人類の殺虫剤による駆除がチャバネゴキブリを進化させた

著者: nagazou
2022年3月25日 16:05
ナショナルジオグラフィック日本版の記事によれば、一部のチャバネゴキブリが、殺虫剤に対する耐性を獲得しているデータが集まりつつあるそうだ。学術誌「Journal of Economic Entomology」に2021年12月に発表された論文によると、米国カリフォルニア州で採集したチャバネゴキブリでは、5種類の殺虫剤に対して生き残るものがいたそうだ。世界では4500種を超えるゴキブリが確認されているが、殺虫剤への体制をアップグレードさせている種はチャバネゴキブリだけであるとのこと。これは人間が害虫の進化を促している一例であると指摘している(ナショナルジオグラフィック日本版)。

あるAnonymous Coward 曰く、

#殺虫剤が選択圧力化しているのだな

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イカリングが豚の腸という嘘ニュース、マレーシアで DNA 検査まで行われる騒ぎに

著者: headless
2022年3月21日 19:37
中国からマレーシアに輸入された冷凍イカリングが豚の腸で作られているという嘘ニュースが広まり、DNA 検査まで行われる騒ぎになっていたそうだ (Berita Harian の記事New Straits Times の記事CNA の記事東方網の記事)。

報道を見る限り、嘘ニュースの内容は豚の腸を輪切りにしたものがイカリングとして扱われているといったものだったようだ。練り製品への混入なら別として、明らかにテクスチャーの違う豚の腸の輪切りとイカリングを間違うことはないと思うが、イスラム教徒が安心して食品を購入できるよう国がハラル認証制度を運営するマレーシアでは重大な問題だ。

マレーシア漁業省は調査の結果、イカリングに豚の DNA は含まれておらず、安全に食べられると発表したそうだ。イカリングを輸入した Shen Hua Resources では、虚偽の情報を広めた 2 名を提訴する準備を進めているとのことだ。

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土佐の蔵元、「宇宙深海酵母」で日本酒を醸造

著者: nagazou
2022年2月15日 06:04
話題としてはやや旧聞に類する話ではあるが、2006年にソユーズロケットに積み込まれた日本酒酵母で作られたという酒があったが、今度はその酵母を水深約6000メートルに沈めたことにより、宇宙と深海という両極端の環境に耐えた酵母で作られたのがウリの酒が造られたそうだ。2019年に行われた実験では深海の気圧に耐えられず絶滅したそうだが、その後に検証を重ねて気圧に強い酵母6種類を選抜したのだそうだ読売新聞オンライン)。

donadona 曰く、

ソユーズで宇宙空間に10日間滞在し、その後4ヶ月間茨城沖の水深6000mに滞在し生き延びた酵母を使った日本酒が2021年12月に発売された(。
プロジェクト責任者の上東治彦・同センター技術支援員によると「宇宙から戻ると果実のような香りを作る成分が増え、深海を経験させると酸味がしっかりし、味わいが深くなったようだ」とのこと。
Before/Afterの飲み比べができたらいいのだが、野暮な話かもしれない。

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シイタケ増収方法、ほだ木に散水してハンマーで10回たたく方法が有効

著者: nagazou
2022年2月7日 14:31
温暖化などの影響で近年はシイタケの低温性品種の収量減が報告されているのだという。この対策として、大分県農林水産研究指導センターは、収穫の現場で経験的に使われていたシイタケの増収方法の条件を公表した。公開により生産者所得の改善につなげたい考えらしい(日本農業新聞)。

具体的な方法としては、原木シイタケのほだ木に散水を行い、ハンマーで表裏5回計10回叩くなどというもの。シイタケはほだ木に振動を与えると発生量が増えるとされ、センターは安全かつ簡易に刺激を与える方法と条件を公開している。ただなぜ収穫量が増えるのかに関しては分かっていないそうだ。

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家畜化されたネコの脳は小さくなってきている

著者: nagazou
2022年1月31日 16:06
ネコは人間に飼われた結果、脳が小さくなっている可能性があるそうだ。ネコが家畜化されてから約1万年ほど経過しているそうだが、ウィーン大学のRaffaela Lesch氏らは、イエネコ(Felis catus)と、その祖先とされているリビアヤマネコ( Felis lybica)、ヨーロッパヤマネコ(Felis silvestris)の頭蓋のサイズを比較した。その結果、イエネコはリビアヤマネコと比べると頭蓋容積が小さい(脳が小さい)ことが示されたという。イエネコとヨーロッパヤマネコの雑種は、2つの親種の中間的な頭蓋容積であったという。こうした家畜化された動物の脳が縮小する傾向は羊、犬、ウサギでも観察されているとのこと(ScienceAlertRoyal Society Open ScienceGIGAZINE)。

あるAnonymous Cat 曰く、

ネコはイヌとは違い完全に飼い慣らされてはおらず、『半家畜化』しているだけだ」という説を覆すものだとウィーン大学のラファエラ・レッシュ氏は記している。

ニンゲンのライフスタイルに寄生し、何もしなくても衣食住が事足りるようになった我々の勝利だニャ!!

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鹿児島県で新種の甲殻類を発見、和名は「オシリカジリムシ」と命名。虚構新聞が誤報

著者: nagazou
2022年1月27日 14:05
鹿児島大学は昨年の5月、ハゼの仲間の尻びれに新種の甲殻類が付着しているのを発見した。この体長1.3ミリほどの新種は、茶色の体に甲羅を持ち、あごの形などが特徴的であることから新しい科の新種と結論づけたという。学名は発見場所の不知火海から「コレフトリア・シラヌイ」と名付けられ、和名に関してはあごを使って尻びれにかじりつくような様子から「オシリカジリムシ」と命名したという。これまでに1個体しか発見されておらず、詳しい生態は分かっていないとしている(NHK時事ドットコムテレ朝NEWS)。

なおオシリカジリムシの存在は虚構新聞が2007年11月15日付の記事で報道していたことが分かっている。虚構新聞の記事の一部が実現してしまい、今回の新種発見で同紙の誤報がまた一つ増えてしまった模様(J-CASTニュース)。

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ヒル(蛭)は木から落ちて来ない。足もとから登ってくる

著者: nagazou
2022年1月27日 06:08
毎日新聞の記事によると、ヤマビルの生態を調査している「子どもヤマビル研究会(略称・ヒル研)」の活動成果をまとめた本が、反響を呼んでいるという。研究では「ヒルは木から落ちてくる」という俗説を、研究員が体を張ってヒルが足もとから最短数分で首まで達する様子を動画に収めるといった実証実験で覆したそうだ。なおタレコミによれば、Wikipediaのヒル (動物)の項目に「ヒルは靴につくとすぐに体の上の方に上がって行き」という記述が2007年9月10日に追加されているとのこと(毎日新聞)。

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